SQL Server 2008 R2からSysPrepが正式にサポートされたようです。これで特に仮想環境での展開がより容易になると思います。
Considerations for Installing SQL Server Using SysPrep
SysPrep を使用した SQL Server のインストールに関する注意点
残念ながら制限があります。
- フェイルオーバークラスタリングは非サポート。
- SysPrepはデータベースエンジンのみのサポート。レポーティングサーバー、アナリシスサーバーは非サポート。
- SQL Server toolsは非サポート
- IA64環境は非サポート
- 以前のバージョンがインストールされている場合も非サポート
詳細は上リンクの文書と下のインストール方法を確認してください。
SysPrep を使用して SQL Server 2008 R2 をインストールする方法
（注意：2010/05/08時点でCTP向けドキュメントです）
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