June CTPをインストールするためにはApril CTPをアンインストールする必要があります。
もちろんふつうにApril CTPをコントロールパネルから削除してもかまわないと思うのですが、SQL Serverにはアンインストールツールが用意されているので、これを使ってみるのもいいでしょう。
アンインストールツールのある場所はDVDのドライブ:\Setup Tools\Build Uninstall Wizardフォルダの中のsqlbuw.exeです。
ダブルクリックにて起動し、後はウィザードの通り作業して行けば問題なくアンインストールできます。
23:25追記
これだけだとJune CTPインストール時に怒られるので、Program Files以下のSQL Serverのフォルダも消しておきましょう。
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